Вопрос: Что может «Яндекс Навигатор», чего не может «Яндекс Карты» ?

Яндекс Навигатор предназначен именно для использования во время вождения автомобиля. Под это полностью оптимизирован его интерфейс. Также он показывает изменение дорожной ситуации (пробки, ДТП) в режиме реального времени и может перестроить маршрут на более быстрый. Ещё он показывает скоростные ограничения на текущем участке дороги и предупреждает в случае превышения, а также подсказывает нужную вам полосу движения при приближении к перекрестку. Ну и, конечно, Навигатор использует в основе GPS сигнал, что позволяет ему определять ваше местоположение куда точнее, чем в Картах.

Навигатор удобнее именно для исползования на дорогах, т.к. по умолчанию выводит метку как для авто и сразу показывает ситуацию на дороге. Но главным преймуществом, как по мне, является навигация по GPS, вместо сотовых вышек и wifi, как это делают почти все карты на андроид для экономии энергии.

На самом деле и карты тоже могут использовать GPS. А остальные преимущества Навигатора перед Картами уже назвали. Только вот я наоборот, ищу преимущества Карт над Навигатором)